Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms