Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LRRC6-201ENST00000250173 1672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL342P-201ENST00000479616 294 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MYL6B-210ENST00000552568 703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 QRFPR-201ENST00000334383 1215 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 C2orf70-202ENST00000409392 764 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SNHG14-220ENST00000553149 513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MIR4294-201ENST00000584548 76 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 PRAMENP-203ENST00000548391 1445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 ZEB2P1-201ENST00000515048 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D2AQ9P2K1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms