Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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