Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms