Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms