Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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