Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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