Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms