Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms