Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFDNP55196 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFDNP55196 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms