Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms