Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms