Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM17Q9Y577 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM17Q9Y577 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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