Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP2Q9UHC6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms