Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms