Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms