Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCDC80Q76M96 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCDC80Q76M96 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms