Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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