Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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