Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms