Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AP3M2P53677 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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