Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms