Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms