Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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