Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms