Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DPM3Q9P2X0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms