Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MCMBPQ9BTE3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms