Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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