Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM7Q9BQ49 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms