Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP34Q70CQ2 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms