Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF18Q5VWM3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF18Q5VWM3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF18Q5VWM3 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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