Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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