Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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