Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRJQ12913 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRJQ12913 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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