Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms