Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms