Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN2Q02246 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms