Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL23P55773 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL23P55773 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms