Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms