Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLCP48506 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms