Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms