Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms