Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms