Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCAP28676 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCAP28676 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCAP28676 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCAP28676 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCAP28676 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms