Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms