Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP2O75323 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms