Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms