Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XIRP2A4UGR9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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