Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms