Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms